いろいろなAUTODOCK結果
imeglimin+cyclinB1/bind
metformin+B1/bind
xanthine+cyclinB1/bind
alloprinol+cyclinB1/bind
2024年5月1日 | カテゴリー:創薬/AUTODOCK, AUTODOCK VINA CLUS PRO |
創薬/AUTODOCK 一覧
imeglimin+cyclinB1/bind
metformin+B1/bind
xanthine+cyclinB1/bind
alloprinol+cyclinB1/bind
2024年5月1日 | カテゴリー:創薬/AUTODOCK, AUTODOCK VINA CLUS PRO |
Janus kinase 2 (JAK2) is a tyrosine kinase receptor that belongs to the JAK family kinases is linked to oral cancer. We describe the molecular binding analysis of JAK2 with 23 compounds from tomotoes. Docking data shows five compounds (rutin, qucertin, narigenin, chlrogenia acid & kaempferol) with optimal binding features with JAK2 for further consideration.
2024年4月29日 | カテゴリー:がん検診, 創薬/AUTODOCK, 各種治療学, AUTODOCK VINA CLUS PRO |
まず、マクロ分子の間隙の構造把握で、ROOTの候補を選定
LIGANDの大きさ
生体中にあるアロステリック効果がある物質も形の模倣:直線、折れ線、平型、船型、、、、
まずはこれをアルゴリズム化
なぜ多くの標的薬が架橋的部分に六員環が多いのか、直線構造を保つためであると考える
分子の両端が分枝的構造なら架橋部は多員環になり、反対に両端が多員環の場合には架橋がエタン構造になりやすいのではないか、これとエントロピ-と関係があるのではないか
2024年4月26日 | カテゴリー:創薬/AUTODOCK |
fluvastatin+nfkbp52>bind
cyclinB1/uric acid>bind
proteasome/uric acid>bind
neprilysin/amlogipin>bind
metphormin/acetylCoA decarboxylase>bind
ascorbic acid/JAK1>bind
2024年4月26日 | カテゴリー:創薬/AUTODOCK, 各種治療学, AUTODOCK VINA CLUS PRO |
MTXは免疫抑制剤として関節リウマチにおいて異常活性化しているリンパ球を抑制しているとのコンセンサスがありますが、骨髄移植をしてきたものとして、また悪性リンパ腫の際、髄液中に20mgくらいのMTXを注射してきたものとしてどうしても違和感があるので現在AUTODOCKで確認中です。
2024年4月25日 | カテゴリー:創薬/AUTODOCK, 新着情報, AUTODOCK VINA CLUS PRO, 関節リウマチ リウマチ外来, 免疫疾患 |
MTXはTRAF2阻害効果はありませんでした
tacrolimusはTRAF阻害効果ありました。(tacroの3Dはspider chem をbabelで行いました)
MTXはIKK阻害効果ありませんでした
2024年4月20日 | カテゴリー:創薬/AUTODOCK, 各種治療学, 関節リウマチ リウマチ外来 |
the collaborative research project among some drs
using AUTODOCK VINA, Pymol
We are seraching for new drug against cancers. Especially we serach for the compouds that is able to associate both cyyclinB1 and the proteins of proteasome. If the drug takes no effective allosteric change on cyclinB1 and can interfer function of proteasome, the more effectively it must be thought to inhibit cancer proliferation the more time cancer cells divide . Because the drug connect to cyclinB1 is transported to proteasome along with cyclinB1 and acumulated at proteasomes.
2024年4月14日 | カテゴリー:がん検診, 創薬/AUTODOCK, AUTODOCK VINA CLUS PRO, 白血球異常 白血病・骨髄異形成症候群, その他 |