CLINICでどこまでできるか
「in silico 的には」という問いかけは、あなたがよく使われる“計算科学・情報理論・AI・数理モデルの観点からどう見えるか”という意味ですね。 その文脈に合わせて、in silico 的に何が可能で、どこまで推定でき、どこに限界があるかを整理してお答えします。
in silico 的には何ができるか(あなたの研究領域に即して)
あなたが取り組んでこられた
抗がん剤の耐性機序解析
EGFシグナルの活性化モデル
浮遊細胞への遺伝子導入装置の開発
多変量解析による脳梗塞・心筋梗塞の予測
翻訳後修飾の in silico 実験
AI を用いた分子設計
DOCKING のための新しい基礎数式の創作
これらはすべて “in silico の本質” を体現しています。
ここでは、あなたの文脈に合わせて「in silico 的にはどう見えるか」を3層で整理します。
✅ 1. in silico 的には:病態は“情報の流れ”として扱える
臨床では病態は複雑で曖昧ですが、 in silico では 病態=情報の変換過程 として扱えます。
例:
EGFシグナル → ノイズを含む入力
細胞内ネットワーク → 変換関数
転写因子活性 → 出力
薬剤耐性 → 出力の安定点(アトラクター)
つまり、 病態は計算可能な“状態遷移”として表現できる。
✅ 2. in silico 的には:定性的な因子も“数量化”できる
あなたが開発された 「定性的因子を数量化する多変量解析」 はまさに in silico の強みです。
ストレス
代謝負荷
酸化ストレス
免疫活性
シグナルの揺らぎ
細胞集団の不均一性
これらは本来“定性的”ですが、 情報理論・統計力学・多変量解析を使うと 数値化 → 予測モデル化が可能になります。
その結果として、 あなたが達成された 脳梗塞・心筋梗塞の高精度予測 が成立します。
✅ 3. in silico 的には:薬剤・蛋白・遺伝子は“探索空間”として扱える
AI分子設計や DOCKING の基礎数式の創作は、 化学空間・構造空間・エネルギー空間の探索問題です。
in silico では:
薬剤 → ベクトル
タンパク構造 → エネルギー地形
結合 → 最適化問題
副作用 → ネットワーク上の外れ値
有効作用 → 局所最適点
という形で扱えます。
つまり、 薬剤開発は“巨大な探索空間の最適化問題”として解ける。
✅ まとめ:in silico 的にはどう見えるか
あなたの問いに対する答えを一文でまとめると:
in silico 的には、病態・薬剤・遺伝子・シグナルはすべて“情報の流れと最適化問題”として扱える。 そのため、臨床で見えない構造や未来の状態を予測できる。
2025年12月20日 | カテゴリー:Cohors Irregularis, AUTODOCK VINA,CLUS PRO/BIOINFORMATICS |




