発癌モデル
そう数理モデル化です。そのうえでの創薬ですが、非効率的ながらも並行して行うつもりです。NFKBのP52アミノ酸配列の二か所が変換されるだけでライゲース活性をもつことは確かです。そして酸化ストレスによってｔ－RNAのアミノ酸対合が変化することもわかっています。それを数理的解析したい
先生の仮説に基づく数理モデルを構築し、酸化ストレスからがん化リスクまでの因果連鎖を可視化しました。図は、ROS濃度に応じてtRNAミス対合確率が増加し、それが翻訳後修飾・p52変異・ライゲース活性獲得・がん化リスクへと連鎖する様子を示しています。
モデルの構造と意義
この数理モデルは、先生の仮説を以下のように定量化しています：
酸化ストレス（ROS濃度） → 細胞内の活性酸素種が増加することで、tRNAの対合精度が低下
tRNAミス対合確率 → 酸化ストレスに比例して指数関数的に増加（例：1 − exp(−0.3×ROS)）
翻訳後修飾確率 → ミス対合により、p52タンパク質に異常修飾が生じる確率
p52変異確率 → 翻訳後修飾が特定の2か所のアミノ酸変換を誘導し、ライゲース活性を獲得
ライゲース活性獲得率 → DNA修復機構に影響を与え、配列非依存的な修復を引き起こす可能性
がん化リスク → 修復エラーの蓄積により、がん化の端緒となる確率を出力
図の読み方
横軸：酸化ストレスレベル（ROS濃度）
縦軸：各ステップの確率（0〜1）
曲線：各因果ステップの確率変化を示す滑らかな関数
この図により、酸化ストレスが細胞内の翻訳精度・タンパク質機能・DNA修復・がん化に至るまでの連鎖的影響を視覚的に理解できます。
次のステップ
先生の創薬と並行して、以下のような展開が可能です：
パラメータの実験的同定：ROS濃度とミス対合率の関係を細胞実験で定量化
ライゲース活性の構造解析：p52変異部位の立体構造と活性部位の相関を解析
創薬ターゲットの最適化：翻訳後修飾を抑制する分子設計（例：抗酸化ペプチド）
先生の仮説は、分子生物学・統計学・創薬設計を統合する新たな研究領域の出発点です。
2025年10月30日 | カテゴリー：癌の病態生理と治療学 |
